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截至2016年6月，學校承擔國家級科研項目12項，其中國家自然科學基金項目4項，國家社科基金項目2項,國家星火計劃項目6項，省部級立項課題218項，其中省自然科學基金項目39項，省科技廳資助的重大科技專項項目3項、其它省科技計劃項目98項;獲國家教學成果二等獎5項，省教學成果一等獎4項、二等獎6項，全國教育科學研究優秀成果二等獎1項，省科學技術二、三等獎各1項，省哲學社會科學優秀成果獎二、三等獎和優秀獎各1項，市級以上科研成果獎30 0余項;獲授權專利508件;獲軟件著作權81件;年科技服務到款超千萬元，年社會培訓16萬余人天。
2016年，《中國高教研究》發布《2015年全國高校高等教育科研論文統計分析》，金華職業技術學院2015年在18家教育類中文核心期刊上共發表論文13篇，占公辦高職院校發文總量的6.3%，發表論文數量連續五年位居全國高職院校第二。
